然而和城镇医保一样，新型农村合作医疗制度也存在医疗机构的大处方、贵处方问题。针对这一现象，陈竺表示，加强对新型农村合作医疗定点医疗机构的监管，控制医药费用不合理的上涨，将是进一步推进和完善新型农村合作医疗的重点工作之一。

　　据了解，截至2007年6月30日，全国合作医疗基金本年度已筹集到位241．47亿元，其中中央财政补助资金到位14．70亿元，地方财政补助资金到位130．80亿元，农民个人缴费91．95亿元及其他渠道4．02亿元。

　　“新型农村合作医疗基金是农民群众的保命钱，我们要多管齐下，保证这笔钱用到刀刃上。”陈竺指出：“中西部地区的当年使用率可能就达不到东部发达地区水平，但我们要求各地要扩大合作医疗受益面，提高受益水平。他强调，基金运行的监管也应当是重中之重，不仅是卫生部门和国家其他相关职能部门要发挥监管作用，还应建立社会各界包括农民在内的监管机制。

　　除了新型农村合作医疗制度运行的有关情况，陈竺还透露目前16部委正紧张工作研究医改方案。解决以药养医的问题应成为新医改的一个内容。